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生物信息技术和生物云平台及小工具使用学习讲座的通知

生物信息学习,从理论到实践,为您详细解读高通量测序大数据,其中包括分析平台转录组数据分析,非编码RNA数据分析,重测序数据分析和biocloud分析流程以及小工具图表制作 (韦恩图、热图、circos图等),序列比对,短序列比对、局部比对、全局比对。

在对传统生物信息分析方法讲解的基础上,加入了对生物云的讲解,将复杂的生物信息分析转化为纯图形化的操作界面,能够让您方便快捷地进行数据分析。

学习时间:

2016年3月15日(全天)-16日(上午),具体见学习课表

学习地点:

山西农业大学图书馆西侧学术报告厅

学习要求:

有操作练习,可自带笔记本电脑(笔记本电脑具备无线网卡,可以无线上网,浏览器推荐使用Chrome或Firefox,提前为笔记本充满电,且能够支持2小时)。

时间

课程主题

课程内容

第一天

3月15日

9:00-9:30

简介

整体介绍(分析平台、小工具、文章数据模块)

9:30-10:30

转录组分析流程

a. 转录组分析原理及应用

b. 无参转录组分析流程及软件应用(Trinity、RSEM、cd-hit、EB-seq)

c. 有参转录组分析流程及软件应用(Tophat、Cufflink)

10:30-12:00

biocloud分析流程

a. 使用云平台完成转录组分析

b. 云平台版结题报告讲解

c. 转录组数据深度挖掘方法

2:00-3:30

非编码RNA分析流程

a. 非编码RNA分析原理简介

b. 非编码RNA分析流程及软件应用

3:30-5:00

biocloud分析流程

a. 使用云平台完成非编码RNA分析

b. 云平台版结题报告讲解

c. 非编码RNA数据深度挖掘方法

第二天

3月16日上午

9:00-9:30

图表制作

常见类型的图表制作(韦恩图、热图、circos图等)

9:30-10:00

序列比对

短序列比对、局部比对、全局比对

10:00-11:00

重测序分析流程

a. 重测序分析原理及应用

b. 重测序分析流程及软件应用

11:00-12:00

biocloud分析流程

a. 使用云平台完成重测序分析

b. 云平台版结题报告讲解

c. 重测序数据深度挖掘方法

图书馆 动科院 农业生物工程研究所 山西省重点实验室 联合举办

2016年3月11日                     

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