生物信息学习,从理论到实践,为您详细解读高通量测序大数据,其中包括分析平台转录组数据分析,非编码RNA数据分析,重测序数据分析和biocloud分析流程以及小工具图表制作 (韦恩图、热图、circos图等),序列比对,短序列比对、局部比对、全局比对。
在对传统生物信息分析方法讲解的基础上,加入了对生物云的讲解,将复杂的生物信息分析转化为纯图形化的操作界面,能够让您方便快捷地进行数据分析。
学习时间:
2016年3月15日(全天)-16日(上午),具体见学习课表
学习地点:
山西农业大学图书馆西侧学术报告厅
学习要求:
有操作练习,可自带笔记本电脑(笔记本电脑具备无线网卡,可以无线上网,浏览器推荐使用Chrome或Firefox,提前为笔记本充满电,且能够支持2小时)。
时间 |
课程主题 |
课程内容 |
第一天
3月15日 |
9:00-9:30 |
简介 |
整体介绍(分析平台、小工具、文章数据模块) |
9:30-10:30 |
转录组分析流程 |
a. 转录组分析原理及应用
b. 无参转录组分析流程及软件应用(Trinity、RSEM、cd-hit、EB-seq)
c. 有参转录组分析流程及软件应用(Tophat、Cufflink) |
10:30-12:00 |
biocloud分析流程 |
a. 使用云平台完成转录组分析
b. 云平台版结题报告讲解
c. 转录组数据深度挖掘方法 |
2:00-3:30 |
非编码RNA分析流程 |
a. 非编码RNA分析原理简介
b. 非编码RNA分析流程及软件应用 |
3:30-5:00 |
biocloud分析流程 |
a. 使用云平台完成非编码RNA分析
b. 云平台版结题报告讲解
c. 非编码RNA数据深度挖掘方法 |
第二天
3月16日上午 |
9:00-9:30 |
图表制作 |
常见类型的图表制作(韦恩图、热图、circos图等) |
9:30-10:00 |
序列比对 |
短序列比对、局部比对、全局比对 |
10:00-11:00 |
重测序分析流程 |
a. 重测序分析原理及应用
b. 重测序分析流程及软件应用 |
11:00-12:00 |
biocloud分析流程 |
a. 使用云平台完成重测序分析
b. 云平台版结题报告讲解
c. 重测序数据深度挖掘方法 |
图书馆 动科院 农业生物工程研究所 山西省重点实验室 联合举办
2016年3月11日